税务局查账主要查收入、成本和费用、合同四个方面。合同方面：查询双方签订合同的具体内容，从企业实际经营范围及需求出发，查看是否存在异常的交易情况；成本方面：主要是成本结转与收入是否匹配，是否有多结转的情况存在；收入方面：主要是查该入帐的是否全部入帐，特别是往来款项是否还存在该确认为收入而没有入帐。
税务局查账会检查的事项如下：
1、纳税人的账簿、记账凭证、报表和有关资料；
2、检查扣缴义务人记账凭证和有关资料；
3、检查纳税人的生产、经营场所和货物存放地；
4、检查纳税人应纳税的商品、货物或者其他财产；
5、检查扣缴义务人与代扣代缴有关的经营情况。
税务机关依法进行上述税务检查时，有权向有关单位和个人调查纳税人、扣缴义务人和其他当事人与纳税或者代扣代缴有关情况。纳税人、扣缴义务人必须接受检查，并有义务如实提供有关材料及证明材料，如实反映情况，不得拒绝、隐瞒。