个人所得税年度汇算清缴是指个人所得税在年度终了后的税款汇总结算清缴工作。为了保证税款及时、均衡入库，在实际工作中，一般采取分月、分季预缴税款，年终汇算清缴，多退少补的征收办法。依据税法规定，年度汇算不涉及财产租赁等分类所得，以及纳税人按规定选择不并入综合所得计算纳税的全年一次性奖金等所得。
分月、分季预缴，一般按纳税人本季度(月)的课税依据计算应纳税款，与全年决算的课税依据往往很难完全一致，所以在年度终了后，必须依据纳税人的财务决算进行汇总计算，清缴税款，对已预交的税款实行多退少补。
各地税务机关应督促网上申报软件开发商、使用适应自身管理需要的自有申报软件的纳税人按发布的标准规范修改，税务机关自行开发的网上申报软件也应按发布的标准规范同步修改，以确保汇算清缴工作顺利开展，确保数据采集的规范、完整、准确，为企业所得税后续管理奠定坚实基础。
各地税务机关应遵循符合标准规范即不禁止的原则，将选择网上申报软件的权利交给纳税人，进一步提升纳税人对税务机关纳税服务的良好体验，确保各地税务机关同时可接收各种网上申报方式报送的企业所得税汇算清缴表单，确保符合本次标准要求的企业所得税申报数据均能进行受理和反馈。